Пишу код:

Для каждого регЗад ИЗ регламентныезадания.ПолучитьРегламентныеЗадания() цикл
	Если регЗад.Расписание.ДетальныеРасписанияДня.Количество() <> 0 Тогда
	Сообщить(регЗад.Расписание.ДетальныеРасписанияДня.Количество());
	регЗад.Расписание.ДетальныеРасписанияДня.Очистить();
	Сообщить(регЗад.Расписание.ДетальныеРасписанияДня.Количество());	
	регЗад.Записать();
	Сообщить(регЗад.Расписание.ДетальныеРасписанияДня.Количество());
	КонецЕсли;
	КонецЦикла;

1С выдает:
2
2
2

почему так?

на ИТС есть обработка по изменению параметров регл.заданий, думаю, там нужно подсмотреть.
емнип, там какая-то хитрость есть, просто так параметры не изменятся.
они точно изменятся, если сервер рестартануть, а вот программно что там нужно дописать - см. обработку

(1) если ты про обработку консоль заданий, то это не вариант.
там изменения вводятся интерактивно, мне нужно - программно