Господа, брейнстурм. Какая-то хрень: с некоего времени запрос перестал возвращать корректные данные. Разбил его на два - ситуация не изменилась.
Грубо говоря - нужно из Заказов вытащить товары.

	нЗапрос = Новый Запрос;
	нЗапрос.Текст =
	"ВЫБРАТЬ
	|	ЗаказПокупателя.Ссылка
	|ИЗ
	|	Документ.ЗаказПокупателя КАК ЗаказПокупателя
	|ГДЕ
	|	ЗаказПокупателя.Проведен
	|	И ЗаказПокупателя.ДатаОтгрузки МЕЖДУ &ДатаНач И &ДатаКон
	|	И НЕ ЗаказПокупателя.Контрагент В(&СписКонтр)";
	нЗапрос.УстановитьПараметр("ДатаНач", НачалоДня(ДатаОтгрузки));
	нЗапрос.УстановитьПараметр("ДатаКон", КонецДня(ДатаОтгрузки)); 
	нЗапрос.УстановитьПараметр("СписКонтр", СписКонтр);
	СписДок = Новый СписокЗначений;
	СписДок.ЗагрузитьЗначения(нЗапрос.Выполнить().Выгрузить().ВыгрузитьКолонку("Ссылка"));
	
	нЗапрос.Текст =
	"ВЫБРАТЬ
	|	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка.Контрагент КАК Контрагент,
	|	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка КАК Заказ,
	|	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка.СкладГруппа КАК Склад,
	|	ЗаказПокупателяТовары.Номенклатура КАК Номенклатура
	|ИЗ
	|	Документ.ЗаказПокупателя.Товары КАК ЗаказПокупателяТовары
	|ГДЕ
	|	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка В(&СписДок)
	|
	|СГРУППИРОВАТЬ ПО
	|	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка.Контрагент,
	|	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка,
	|	ЗаказПокупателяТовары.Номенклатура,
	|	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка.СкладГруппа";
	нЗапрос.УстановитьПараметр("СписДок", СписДок);
		
	нТЗ = нЗапрос.Выполнить().Выгрузить();

При этом СписДок сформирован корректно, все документы там есть. А в итоговой нТЗ большей части документов нет.
Это как?
Это лыжи, или я? И если я, то где?..

Попробуй СписДок сделать массивом, а не СпискомЗначений.

(1) вообще это всё изначально было одним запросом. Все условия там замечательно применялись. Потом работать перестало. Решил разделить. Т.е. этот чёртов СписДок (вместе с первым запросом) - лишняя часть, просто ради того, чтобы мне убедиться, что эти документы по условию в принципе отбираются.

Ну тогда нужно думать где может сбоить и в отладке пройтись пошагово не один раз...

Например - только ТЧ Товары, или ТЧ Услуги тоже?...

(0) почему ты не используешь соединение таблиц в запросе?

(4) чтобы отладчиком смотреть, пошагово. Собранный запрос выдаёт фигню. Я его декомпозировал, так сказать.

(5) консоль запросов на что?

(6) ну вообще - да. Ты прав.
Но что это в сабже изменит?

(0) потому что в тех документах не заполнена таб часть

ну ты Дуб реально

(8) разумеется - заполнена

Дуб СписДок.ЗагрузитьЗначения(нЗапрос.Выполнить().Выгрузить().ВыгрузитьКолонку("Ссылка"));

Нафига ты в список значений грузишь. Можно просто массив

Запрос можно так сделать, если ты хочешь и первый результат получить и на всякий случай вычислить заказы без товаров, хотя.. откуда это, если ещё документы проведены. Ну ладно

ВЫБРАТЬ
	ЗаказПокупателя.Ссылка КАК Заказ
ПОМЕСТИТЬ ВтЗаказы
ИЗ
	Документ.ЗаказПокупателя КАК ЗаказПокупателя
ГДЕ
	ЗаказПокупателя.Проведен
	И ЗаказПокупателя.Дата МЕЖДУ &ДатаНач И &ДатаКон
	И НЕ ЗаказПокупателя.Контрагент В (&СписКонтр)
;

////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
ВЫБРАТЬ
	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка.Контрагент КАК Контрагент,
	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка КАК Заказ,
	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка.СкладГруппа КАК Склад,
	ЗаказПокупателяТовары.Номенклатура КАК Номенклатура
ИЗ
	ВтЗаказы КАК ВтЗаказы
		ВНУТРЕННЕЕ СОЕДИНЕНИЕ Документ.ЗаказПокупателя.Товары КАК ЗаказПокупателяТовары
		ПО ВтЗаказы.Заказ = ЗаказПокупателяТовары.Ссылка

СГРУППИРОВАТЬ ПО
	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка.Контрагент,
	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка,
	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка.СкладГруппа,
	ЗаказПокупателяТовары.Номенклатура
;

////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
ВЫБРАТЬ
	ВтЗаказы.Заказ КАК Заказ
ИЗ
	ВтЗаказы КАК ВтЗаказы
		ЛЕВОЕ СОЕДИНЕНИЕ Документ.ЗаказПокупателя.Товары КАК ЗаказПокупателяТовары
		ПО ВтЗаказы.Заказ = ЗаказПокупателяТовары.Ссылка
ГДЕ
	ЗаказПокупателяТовары.Ссылка ЕСТЬ NULL

Короче - mea culpa, как обычно. Всем спасибо.